Prof. Dr. Ömer Göktekin 1969 yılında Zonguldak'ta doğdu. 1986-1992 yılları arasında İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Fakültesi'ni bitirdi. 1992-1997 yılları arasında Dr. Siyami Ersek Göğüs Kalp ve Damar Cerrahisi Eğitim Araştırma Hastanesi'nde Kardiyoloji Uzmanlık eğitimi aldı.

2003 yılında doçent ünvanına, 2008 yılında profesör ünvanına sahip oldu. 1997-1999 yılları arasında Vakıf Gureba Hastanesi'nde Kardiyoloji Uzmanı olarak, 1999-2010 yılları arasında Osmangazi Üniversitesi Kardiyoloji Anabilim Dalı Öğretin Üyesi olarak, 2010-2017 yılları arasında Bezmi Alem Vakıf Üniversitesi Tıp Fakültesi'nde Kardiyoloji Anabilim Dalı Başkanı olarak görev yaptı.

2017-2018 yılları arasında Memorial Hizmet Hastanesi'nde Kardiyoloji Uzmanı olarak, Memorial Şİşli Hastanesi'nde Kardiyoloji Uzmanı olarak çalıştı. Prof. Dr. Ömer Göktekin şuanda Memorial Bahçelievler Hastanesi'nde Kardiyoloji Uzmanı olarak hizmet veriyor.