Prof.Dr.Ejder Kardeşoğlu 1990 yılında Gülhane Askeri Tıp Fakültesi'nden mezun oldu.1997 yılında Gülhane Askeri Tıp Akademisi Kardiyoloji Anabilim Dalında uzmanlık eğitimi aldı.

1997 – 2001 yılları arasında Hava Hastanesi Güzelyalı - İzmir'de,  2001 – 2006 yılları arasında GATA Haydarpaşa Eğitim Hastanesi Yardımcı Doçent olarak, 2006 – 2012 yılları arasında GATA Haydarpaşa Eğitim Hastanesi Doçent olarak, 2012 – 2016 yılları arasında GATA Haydarpaşa Eğitim Hastanesi Profesör olarak görev yaptı. 

Prof.Dr.Ejder Kardeşoğlu şuanda Medicana Çamlıca'da Kardiyoloji bölümünde hizmet vermeye devam ediyor.