Prof. Dr. Muzaffer Çetingüç 1973 yılında İstanbul Üniversitesi İstanbul Tıp Fakültesini , 1975 Gülhane Askeri Tıp Akademisi Askeri Tıp Fakültesi'ni bitirdi. 1980 yılında Gülhane Askeri Tıp Akademisi Ruh Sağlığı ve Hastalıkları alanında uzmanlık eğitimi aldı. 

1992 yılında Gülhane Askeri Tıp Akademisi Askeri Tıp Fakültesi doçentlik ünvanına, 2014 yılında İstanbul Üsküdar Üniversitesi Tıp Fakültesi profesör ünvanına sahip oldu. 

1974 - 1977 yılları arasında İzmir Hava Kuvvetleri Komutanlığı 2. Ana Jet Üs ve Uçuş Okulu'nda, 1980 - 1992 yılları arasında Eskişehir 600 Yataklı Hava Hastanesi Psikiyatri Kliniği'nde, 1992 - 1997 yıllarında Gülhane Askeri Tıp Akademisi Hava ve Uzay Hekimliği, Fizyolojik Eğitim Merkezinde çalıştı. 

1997 - 1998 yılları arasında Eskişehir Hava Kuvvetleri Komutanlığı Fizyolojik Eğitim Merkezi ve Muayene Merkez Başkanlığında, 2000 - 2016 yıllarında Havacılık Tıbbi Derneğinde, 2010 - 2012 yıllarında Sivil Havacılık Akademisi'nde,  2011 yılında Anadolu Üniversitesi Havacılık ve Uzay Tıbbı Uygulama ve Araştırma Merkezinde, 2011 - 2014 yıllarında Anadolu Üniversitesi Havacılık ve Uzay Tıbbı Uygulama ve Araştırma Merkezinde görev yaptı. 

İngilizce bilen Prof. Dr. Muzaffer Çetingüç 2010 yılından bu yana Eskişehir Acıbadem Hastanesi'nde Psikiyatri bölümünde hizmet veriyor.